为使土尔扈特摆脱被吞并的命运，大约在明崇祯元年（公元1628年），和鄂尔勒克汗率本部及和硕特、杜尔伯特的部分牧民共5万余帐向西南方移去。他们沿托波河上游挺进，途经诺盖草原，击溃企图阻止他们西进的诺盖人，越过哈萨克地区，渡乌拉尔河，抵达还未完全被俄国开发的伏尔加河下游。他们虽身处异域，却保持厄鲁特蒙古本色，生活上“习蒙古俗，务畜牧，逐水草徙”，管理上“置鄂拓克，设宰桑”，信仰上“重佛教，敬达赖喇嘛”，完全是独立于沙俄的一个游牧部落。
土尔扈特西迁后，一直不忘故土，与厄鲁特蒙古各部保持着联系。和鄂尔勒克汗曾将女儿嫁给准部马图尔浑台吉，马图尔浑又把女儿嫁给土尔扈特的朋楚克，朋楚克将女儿嫁给和硕特的鄂齐尔图车臣汗；尔后土尔扈特汗阿玉奇的女儿则嫁给策妄阿拉布坦，和硕特车臣汗之女又嫁给阿玉奇长子沙克都尔扎布，噶尔丹策零之女嫁给土尔扈特的马图尔乌巴什。这些婚姻关系，表明土尔扈特部一直视自己为厄鲁特蒙古家族的一员。
身居异域的土尔扈特，与清朝同样往来不绝。顺治十二年（公元1655年），和鄂尔勒克汗长子书库尔岱青遣使向清朝“奉表贡”。因“蒙古俗最重喇嘛”，书库尔岱青还亲自入藏“熬茶、供佛、谒达赖喇嘛”。康熙年间，土尔扈特汗阿玉奇之嫂携子阿喇布珠尔入藏礼佛，归途“以准噶尔道梗，留嘉峪关外，遣使到京师，请内属”。当康熙出兵西北时，土尔扈特部在军事上和道义上支持清军平定准噶尔贵族叛乱。三十五年（公元1696年），平定噶尔丹的战役中，阿玉奇汗闻讯派宰桑率1000余人赴阿尔泰的土鲁图地方协助清军。战争结束后，他又派人向清朝“入贡祝捷”。康熙五十五年，策妄阿拉布坦叛乱，清廷命和硕特部派兵扼守准部通青海、西藏的要隘噶斯。阿玉奇汗的侄子阿喇布珠尔时在青海，主动请命效力，率300人屯守噶斯。